L’Institut Pasteur d’Algérie abritera du 13 au 17 août 2023, une formation internationale sur le séquençage génomique des virus grippaux et du SARS-CoV2. Onze pays africains de la région africaine de l’OMS, à savoir l’Algérie, le Burkina Faso, la Côte d’Ivoire, le Madagascar, le Mali, la Mauritanie, le Niger, la République Démocratique du Congo, la République Centrafricaine, le Sénégal et le Togo, y prennent part.
Le cours organisé avec l’appui de l’Organisation Mondiale de la Santé (OMS) , le Centre Américain pour le Contrôle et la Prévention des Maladies (CDC-Atlanta) et l’Association des laboratoires de santé publique (APHL), se décline sous forme de formation en laboratoire. L’institut Pasteur d’Algérie indique dans son communiqué que cet acte pédagogique “portera sur le renforcement des capacités dans le domaine du séquençage de nouvelle génération des virus de la grippe et du SARS-CoV-2”.
Plusieurs objectifs sont alloués à ce cours qui tombe à point nommé. Les organisateurs visent la formation des participants aux méthodes expérimentales de séquençage de nouvelle génération en vue du séquençage rapide d’échantillons respiratoires s’étant révélés positifs pour un virus de la grippe ou du SARS-COV-2, et aux principes bioinformatiques de l’analyse des données de séquençage à partir d’échantillons cliniques : contrôle de qualité des données, alignement et assemblage des séquences, analyses phylogénétiques et soumission des séquences dans la base de données publique GISAID.
L’autre target visé par l’institut Pasteur d’Algérie et ses partenaires est le renforcement des capacités de surveillance nationale et régionale des agents pathogènes respiratoires à travers les laboratoires du système mondial de surveillance de la grippe et de riposte (GISRS), en améliorant le séquençage génomique, l’analyse bioinformatique et le partage des données.
Notons que le séquençage génomique des virus grippaux (influenza) et du SARS-CoV (le virus responsable du syndrome respiratoire aigu sévère, ou SRAS) est une technique essentielle pour comprendre la structure génétique de ces virus, leur évolution, leur transmission et leur réponse aux traitements médicaux.
Meriem Azoune
